Znanstveno vijeće je stručno vijeće Instituta za javne financije koje, između ostaloga prema Statutu, utvrđuje i provodi znanstvenu politiku Instituta; raspravlja i odlučuje o znanstvenim i stručnim pitanjima iz rada Instituta; provodi dio postupka izbora u znanstvena zvanja, kad je Institut za to ovlašten; provodi postupke izbora na znanstvena, suradnička i stručna radna mjesta; imenuje i razrješuje jednog člana Upravnog vijeća; predlaže Upravnom vijeću kandidate za natječajni odbor za izbor ravnatelja Instituta; raspravlja o proračunu Instituta i daje prethodno mišljenje ravnatelju Instituta o proračunu.
Znanstveno vijeće čine znanstvenici izabrani na znanstvena radna mjesta te suradnici izabrani na suradnička radna mjesta asistenta i poslijedoktoranda.
Članovi Znanstvenog vijeća Instituta za javne financije su: